天水南站是寶蘭客運專線的重要中間站，寶蘭客運專線天水南站位于城市南側秦州區與麥積區之間，北側為城市主干道羲皇大道，車站總建筑面積24000多平方米，站房建筑面積12000平方米，按三站臺七道設計，車站有立折能力，可辦理始發終到業務。

 　  寶蘭客專自西寶客專寶雞南站引出，經天水、秦安、通渭、定西、榆中，至蘭州西站。全線共設東岔、天水南站、秦安、通渭、下小岔、定西南站、榆中、蘭州西客站等8個車站。其中：下小岔站為越行站，蘭州西客站為客運始發站，天水南站為有立折條件的中間站，其他車站均為客運中間站。

 　　寶蘭客運專線天水段

 　　寶蘭客運專線在天水市的線路基本走向為：從牛背梁進入天水境內，橋隧相連，途經麥積區東岔鎮、立遠鄉,在交川溝設東岔站，后經吳砦鄉、元龍、伯陽，跨渭河至社棠，從規劃工業園區北緣通過，再跨至渭河南岸，經馬跑泉鎮，在二十里鋪鎮花牛村和趙崖村之間設天水南站，出站后橋隧穿越藉河及北山，跨過隴海線南河川車站，經三陽川，跨過渭河，北行出楊家山隧道后溯葫蘆河而上，于秦安縣城西側、天公路和葫蘆河之間設秦安站，后經郭嘉鎮，穿大神仙梁，在中川牛谷河進入定西通渭縣境內。線路在我市境內路長約115公里，其中橋隧長105.8公里，橋隧比為92%。設計行車速度為每小時250公里，靜態投資約150億元，設東岔、天水南、秦安三處中間站。