疫病種類不斷增多
隨著我國水禽規模化養殖的比例不斷增加，水禽疫病開始逐年增多，呈現出老病繼續流行，新病不斷出現的狀況，過去認為水禽抵抗力強、疫病少的觀點逐漸被改變。以往水禽病僅有鴨瘟、小鵝瘟、大腸桿菌病等少量常見病，但近年來，出現了很多新的烈性傳染病，如：副粘病毒病、禽流感、出血性壞死性肝炎、傳染性漿膜炎等；此外，一些發生于雞的支原體病、傳染性法式囊炎也能傳染鴨或鵝，并有上升趨勢；還有不少寄生蟲病、中毒病、營養代謝病以及應激性因素都對水禽的養殖帶來嚴重影響。
其中，鴨出血性卵巢炎尤其值得關注。據廣東佛山科技學院王政富副教授介紹，2010年6月以來，我國自北向南主要在白羽種鴨和蛋鴨中發生一種以突發產蛋急劇下降為特點的疾病，種鴨普遍發病，商品鴨感染嚴重，因其主要病變為卵泡變性，卵泡膜充血、出血，卵巢萎縮，故將該病稱之鴨出血性卵巢炎。經研究，初步認為由鴨黃病毒感染所致，是一種新的鴨傳染病。采用自家滅活組織水苗緊急免疫，效果好差不一。大型種鴨場須積極研制滅活油乳苗進行主動免疫。
傳播途徑多種多樣
對水禽而言，其疫病傳播的途徑往往是多種多樣。中國農大動醫學院張大丙副教授透露，去年夏天我國鴨病較為嚴重，并且傳播范圍較廣，其原因較為復雜。從季節因素考慮，可能是蚊傳類病毒通過蚊蟲叮咬而導致的大范圍傳播；從發病鴨場現場發現麻雀死亡現象來看，有可能是鳥類遷移傳播。
疫病防控形勢嚴峻
據揚州大學獸醫學院朱國強教授介紹，有些疾病雖然在國內流行較久，但其病原已發生了變異，比如鴨病毒性肝炎；有些疾病出現了新的病原，如鴨星狀病毒；過去某種被認為水禽可感染但不發病的病原，也已轉變為致死性感染，比如副粘病毒病?？傮w而言，儲主、病原的變異和毒力的增強，使得水禽疫病的防疫形勢比我們想象得更為嚴峻。
疫苗研發相對滯后
通過疫苗免疫是最有效的防病措施之一，而當前我國水禽專用疫苗的數量和種類卻極為有限。中國獸醫藥品監察所研究員范書才表示，目前的水禽專用疫苗僅包括鴨瘟活疫苗、小鵝瘟活疫苗、番鴨細小病毒活疫苗、鴨漿膜炎滅活疫苗(1型)等。禽類兼用疫苗主要有禽流感滅活疫苗、禽巴氏桿菌滅活疫苗等，且生產廠家極少?？傮w而言，疫苗種類太少，并且存在安全性隱患或效力不穩定，運輸、儲藏和使用不方便等問題。范書才說，國內各大生物制品公司正在加大各類水禽專用疫苗的研發和應用，其中鴨瘟滅活疫苗已經取得生產文號，并通過了批簽發。禽流感(H5亞型)鴨瘟二聯滅活疫苗、禽流感(H9亞型)鴨瘟二聯滅活疫苗、雛鴨病毒性肝炎二價滅活疫苗正在研制當中，目前進展順利。
王政富指出，以肉鴨為例，目前大多數傳染病無疫苗可用，由此給疫病防控帶來極其被動的局面。
防控系統亟待完善
水禽疫病的防控是一個系統工程，涉及到養殖的各個環節。中國農科院家禽研究所研究員戴亞斌認為，需要從生物安全管理、帶毒情況監測、積極采取免疫、加強基礎研究等環節全面開展，方能產生實效。其中，飼養條件的改善尤其值得關注，應盡可能轉變粗放的飼養模式，改放養為圍欄飼養，改同一地區混雜飼養多種禽類為單一品種飼養，實行全進全出，同時避免與野生水禽接觸。
雖然當前我國水禽產業發展迅速，生產規模不斷擴大，但水禽疫病防控體系的建設還相當落后，其重視程度不夠，與產業發展趨勢不相適應，嚴重制約了整個行業的健康穩定發展。
張大丙副研究員結合國家水禽產業技術體系的調研報告進一步指出，疾病防治是廣大水禽養殖戶和養殖企業最為關注的環節，而近十多年來新型傳染病的發生和流行，不但危害水禽的健康，而且也給食品安全帶來隱患。
因此，進一步加強水禽疫病的監測與防控已迫在眉睫，刻不容緩。
關于水禽疫病的免疫，其強度究竟應該如何？關于水禽疫苗的研制，究竟該使用多大劑量的毒株？這往往形成一種矛盾，如何掌控好這其中的平衡關系，是一門學問，只能是仁者見仁，智者見者了。
就政府層面而言，最大限度地減少和控制疫病發生是其追求的目標，以宏觀控制和全面掌控為主。而養殖戶出于自身一時利益的考慮，首先想到的是如何確保不發病或少發病，由于其認識水平有限，往往認為疫苗的毒株越強、劑量越高，其效價就越好、保護力就越強。應該說，這是一種急功近利的表現，從某種程度而言，對養殖戶造成的長期傷害遠遠大于這一時之利。
對此，王政富副教授建議，一方面，養殖戶要加強飼養管理和生物安全體系建設，正確合理用藥，用科學的方法進行疫病防控。另一方面，行業主管部門要降低水禽疫苗尤其是鴨用疫苗的審批門檻，這樣既有利于加快高等院校和科研院所的成果轉化，又能保障鴨群免受疫病的危害，一舉雙得，從而促進水禽產業健康快速發展。但需要區別對待的是，病毒性疫苗強調針對性，細菌性疫苗強調多樣性。
